Omics för klinisk mikrobiologi och infektionssjukdomar, 2 hp
Omics approaches for Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2 credits
Kursuppgifter
Kursens innehåll
Kursen ges i samband med den 39:e NSCMID vilken äger rum 20-21 september 2023 på Campus USÖ, Örebro universitet. Kursen hålls av experter inom olika omics relevanta för klinisk mikrobiologi och infektionssjukdomar. Kursen ges i form av föreläsningar med tid för diskussioner och interaktion med föreläsare och experter inom området.
Kursinformation
Kursens huvudsakliga syfte är att ge kunskap i omics-metodologier (metagenomics, proteomics, metabolomics samt grundläggande dataanalys) som används dels inom forskning men även tillämpningar av dessa metoder för kliniska frågeställningar och analys av för kliniska frågeställningar väsentliga komponenter. Vidare kommer kursens design vara sådan att metoderna presenteras och behandlas i sammanhang för att göra dem relevanta för kliniska forskare.
Tillträdeskrav
För att få delta i kursen och de prov som ingår i kursen ska sökanden vara antagen till utbildning på forskarnivå vid ett europeiskt lärosäte.
Anmälan
Anmälan för kursen är stängd.
Kontakt
Kursansvarig och examinator: Alexander Persson
Kursadministration: fouadm.mv@oru.se
Schedule September 20th
13.00 - 13.30
Introduction lecture: Views from a clinical researcher and a clinicial practitioner
13.30 - 14.30
Technical aspects and application of proteomics in infection medicine
Clinical perspectives of proteomics
14.30 – 15.00 Swedish Fika (coffee break)
15.00 – 16.00
Technical aspects and considerations of metabolomics
Applications of metabolomics in sepsis and bacteremia
16.00 - 17.00
Technical aspects and considerations of metagenomics
Applications of metagenomics in microbiota- and preclinical research
Applications metagenomics in diagnostics
Schedule September 21st
08.30 – 10.00
What to consider before sample collection / data generation
Basic biostatistics, what to do yourself and which additional competences do you need to collaborate with?
How to approach and talk to a bioinformatician
Integration and use of AI in infection medicine
10.00– 11.00
Moderated discussion
11.00 – 11.15
Concluding remarks