Exposom och systembiologi i hälsa och sjukdom, 15 hp

Kursen består av två moduler, "exposomet inom mänsklig hälsa och sjukdom" och "systembiologi och kunskapsrepresentation".

Exposomet är ett koncept som används för att beskriva de miljöexponeringar som en individ möter under hela livet och hur dessa påverkar biologin och hälsan. Det omfattar både externa och interna faktorer, inklusive kemiska, fysiska, biologiska och sociala faktorer som kan påverka människors hälsa. Studien av exposomet har blivit ett värdefullt verktyg för att förstå samspelet mellan genetiska och miljömässiga faktorer i utvecklingen av sjukdomar, med särskilt fokus på kroniska tillstånd. Konceptet har tillämpats brett inom områden som epidemiologi, toxikologi och folkhälsa, och har lett till betydande framsteg i vår förståelse av sjukdomsetiologi och förebyggande.

De centrala forskningsområdena som ingår i kursen är användningen av toppmoderna och framväxande experimentella tekniker för att bedöma hur externa (t.ex. miljökemikalier, socioekonomiska faktorer osv.) och interna (t.ex. tarmmikrobiom, metabolom, immunsystemets status) exponeringar påverkar hälsan under livets gång och medierar risken för olika sjukdomar. Med tanke på datans och informationens flerdimensionella komplexitet krävs ett systembiologiskt tillvägagångssätt för att förstå hur exposomet påverkar mänsklig hälsa och sjukdom.

Systembiologi är databaserad hypotesdriven biologisk forskning: genom att formalisera biologisk kunskap i ett strikt format kan vi ta hjälp av datorn för att resonera om biologiska hypoteser (datamodeller). Målet är att förstå hur systemets funktion uppstår ur och formas av underliggande biologiska mekanismer. Systembiologi är därmed närbesläktat med Kunskapsrepresentation, ett fält inom AI-forskningen som fokuserar på att formalisera kunskap och utveckla metoder för Machine Reasoning. Systembiologimodulen fokuserar på metoder för att söka och formalisera biologisk kunskap i kunskapsmodeller, metoder för visualisering och simulering av dess modeller, på användning av modellerna för att förstå biologiska funktioner, och på systembiologicykeln med förutsägelser och valideringsexperiment.

Fördjupning

Avancerad nivå, har endast kurs/er på grundnivå som förkunskapskrav (A1N)

Institution

Institutionen för medicinska vetenskaper