Bioinformatik
Om gruppen
Gruppuppgifter
Kontaktperson
Forskningsämne
Forskningsmiljöer
- Centrum för Livsvetenskap
-
Responsive Nutrition Research Centre
Bioinformatik syftar till att utveckla metoder och verktyg för att analysera data inom biovetenskap, och i synnerhet inom medicinsk vetenskap. I vår grupp arbetar forskare samt doktorander och masterstudenter i många lokala, nationella och internationella forskningsgrupper på ett verkligt tvärvetenskapligt sätt. Vid Örebro universitet samarbetar vi med flera av de stora forskargrupperna vid Institutionen för medicinska vetenskaper, men också tillsammans med datorvetenskaps artificiell intelligens forskning och kemisternas miljövetenskap. Vi är också en integrerad del av det nya Centrum för precisionsmedicin i Örebro universitets samarbete med Universitetssjukhuset Örebro (Region Örebro län). I flera projekt arbetar vi tillsammans med grupper inom inflammationsforskning, kardiovaskulär forskning, IBD-forskning, Precision Nutrition forskning och Gut-Brain-Microbiota-Interaction forskning.
När det gäller metodutveckling fokuserar gruppen på att förstå hur man kan inkludera mekanistisk kunskap för prediktiva modeller inom precisionsmedicin. Vi arbetar med data där många kliniska och molekylära data mäts samtidigt och ofta också över flera tidpunkter. Modeller från systembiologi, artificiell intelligens och klassisk statistik försöker vi kombinera till vad vi kallar hybridmodeller, som kan användas för precisionsmedicin.
Forskningsprojekt
Pågående projekt
- Biosignatures and functional network structures
- Cell Painting: a novel tool in toxicology (CPTox)
- Metabolomics signatures in medical and environmental pattern studies
- Network medicine and systems biological approaches to modeling inflammation
- Proteome signatures in IBD
- Systematic modelling: quantitative and semi-qualitative implementations of nutrition-microbe-gut-blood-brain interactions regarding the role of butyrate
- X-HiDE